Анализы на основе CRISPR кажутся надежными для тестирования и выявления вспышек тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2) в учреждениях высшего образования, согласно исследованию, опубликованному в феврале. 11 место в JAMA Network Open.
Дженнифер Н. Раух, к.D., из Калифорнийского университета в Санта-Барбаре и его коллеги использовали CREST (основанное на Cas13, надежное, справедливое, масштабируемое тестирование), тест на основе CRISPR и контрольную количественную полимеразную цепную реакцию обратной транскриптазы (RT-qPCR ) тест для оценки распространенности SARS-CoV-2 у бессимптомных участников в университетском сообществе. В анализ были включены 1808 бессимптомных участников, которые самостоятельно собирали образцы мазков из ротоглотки с 28 мая по 11 июня 2020 г. и с 23 июня по 2 июля 2020 г. (732 и 1076 человек соответственно).
Исследователи обнаружили, что все результаты тестов были отрицательными для ранней когорты, но было девять положительных результатов с помощью RT-qPCR в более поздней когорте. Восемь из девяти положительных образцов были обнаружены с помощью анализа на основе CRISPR и подтверждены диагностическим тестированием, сертифицированным поправками Clinical Laboratory Improvement. Средний возраст людей с положительными случаями составил 21 год.7 лет, когда все позитивные люди идентифицируют себя как студенты. В бессимптомных случаях обнаруженная вирусная нагрузка была аналогична той, которая наблюдалась в клинических образцах, что подчеркивает возможность скрытой передачи вируса. Ослабление мер по сохранению дома совпало со сдвигом в распространенности вирусов.
"Согласованность между тестированием RT-qPCR и нашей стратегией использования мазков из ротоглотки и анализа на основе CRISPR обосновывает возможность использования более простых, столь же надежных подходов для повторного тестирования большого объема, что является желательной стратегией для облегчения повторного открытия колледжей и университетов," авторы пишут.
Несколько авторов раскрыли находящиеся на рассмотрении патенты на методы обнаружения, использованные в исследовании.